El Programa de Maestría en Ciencia de la Ingeniería fue creado como resultado de la reestructuración de los Posgrados de la DES de Ingeniería y Tecnológicas de la Universidad, en el cual participaron las Unidades Académicas de Ciencias de la Tierra, Ingeniería I, Ingeniería Eléctrica y Ciencias Químicas, a través de los  Cuerpos Académicos UAZ-CA 55, UAZ-CA 56, UAZ-CA 66, UAZ-CA 68, UAZ-CA 177, UAZ-CA 178 y UAZ-CA 182.

El programa inició sus actividades académicas en el semestre escolar enero-agosto del 2011, ofreciendo las siguientes orientaciones:

1.   Energía renovables y ciencias ambientales

2.   Materiales

3.   Procesamiento de señales y mecatrónica